花为圆锥状花序，花序长2-8厘米。品种不同，花序大小和花数量有差异，一般每个花序上着生十几朵到三十几朵小花。花序主要为腋生，少数可由顶芽抽生。两性花，但常有雌蕊发育不全的不完全花（雄蕊正常，雌蕊退化），或称退化花，畸形花。不完全花的比例因品种和植株的营养状况而不同。大多数油橄榄品种有自交不亲和性，自花授粉结实率低。油橄榄的花很小，每朵花的下面具有较短的花柄和一个很小的苞片，花柄顶部膨大形成花托。萼片四个结合成为漏斗状。花冠上部为四裂片，下部成筒状。雄蕊两个，分别着生在花瓣愈合处。雌蕊由两个心皮组成，着生在花托上，子房上位绿色，花柱短，长0.4-0.6毫米，柱头分叉，子房二室，各着生两个胚珠，但一般仅有一个发育，成熟后形成一粒种子。