花为圆锥状花序,花序长2-8厘米。品种不同,花序大小和花数量有差异,一般每个花序上着生十几朵到三十几朵小花。花序主要为腋生,少数可由顶芽抽生。两性花,但常有雌蕊发育不全的不完全花(雄蕊正常,雌蕊退化),或称退化花,畸形花。不完全花的比例因品种和植株的营养状况而不同。大多数油橄榄品种有自交不亲和性,自花授粉结实率低。油橄榄的花很小,每朵花的下面具有较短的花柄和一个很小的苞片,花柄顶部膨大形成花托。萼片四个结合成为漏斗状。花冠上部为四裂片,下部成筒状。雄蕊两个,分别着生在花瓣愈合处。雌蕊由两个心皮组成,着生在花托上,子房上位绿色,花柱短,长0.4-0.6毫米,柱头分叉,子房二室,各着生两个胚珠,但一般仅有一个发育,成熟后形成一粒种子。